出身香港社会最底层的丁小嘉（佘诗曼 饰）在考上警察后，又以卧底的身份重回鱼龙混杂的砵兰街，替CID督查康道行（欧瑞伟 饰）搜集情报。谁知在追查三合会头目游达富的犯罪事实过程中，道行意外遇害身亡。他在临死前为防止手下卧底人员身份暴露，而删除了包括小嘉在内等五名卧底的纪录。在此之后，道行的同袍刑事情报科总督察卓凯（苗侨伟 饰）联系到小嘉，希望其能协助找到其他四名卧底，并掌握外围赌博集团的犯罪证据。
故事发生在明朝年间，四海（陈锦鸿 饰）是杀人不眨眼的刽子手，和江湖郎中水如尘（谢天华 饰）结为义兄弟，两人一同踏上旅程，在误打误撞之中来到了一座名为昌隆的小镇之中。昌隆镇不大，处处洋溢着欢乐的气氛，然而，在这轻松而又平和的表面之下，隐藏着激烈汹涌的暗流，埋葬着不为人知的秘密。在镇上，四海和水如尘遇见了镇上的首富霍天命（岳华 饰）和他的女儿霍倩瑶（廖碧儿 饰）。在阴差阳错之中，四海和霍倩瑶竟然结为了夫妻。镇上接连发生了数起命案，搅得人心惶惶，四海和水如尘开始了对案件的调查，却发现镇上发生的一切，和他们两人有着千丝万缕的关联。
一个以CID为故事主干线的剧集，对剧中警探除工作外的个人性格均有深刻描述，主角人物童芷珊在工作、家庭、爱情三方面的剧情更具吸引力。杨森（曾江）与陈刚（吕良伟）在警界共事多年，已成知交。刚已婚，并有一子，夫妇二人感情甚好。森则脾气刚烈，经常被投诉，於是常有机会与投诉科女沙展郭倩宜接触。森虽然在工作上与宜是对立，但私底下却对宜展开追求，後得刚之帮助，森终夺得美人归。刚与妻恩爱非常，但不幸地在一宗抢劫案中，刚妻被匪徒枪袭身亡，使刚大受打击。经此之後，刚性格已变为冷酷深沉，不苟言笑。数年後，森已升为沙展，宜亦升为警民关系科主任。森对众手足极为关怀，唯脾气仍然火爆，与宜在工作上的矛盾，日形严重，导致日後夫妇在感情上，出现危机。童芷珊（陈玉莲）是森手下一名女探员，家庭背景极为复杂，本与母及妹相依为命，及後珊母再嫁给一名好食懒非的歌手，引致珊与妹的不满，家庭冲突时起。珊的性格孤僻，冷若冰霜；其实外冷内热，对其妹尤其关心，而且在工作上，干劲十足，甚获森的赏识。
韦福荣、陈炳基、罗家辉这三个同居客兼好友，各人背景不同、遭遇各异、郄同样有着“男人四十”的困惑……。韦福荣，卅九岁，独身，AW广告公司创作总监，曾经是广告界的风云人物，从事广告 创作的十数年间，屡获本地及国际广告大奖，相信只要有电视机及广告牌的地方，便会有他的广告。陈炳基，卅九岁，独身，尖端补习社校长兼创办人，人称“补习天王之父”。罗家辉，卅八岁，独身，是秋天话剧团的成员暨文书暨打杂暨茶水……也是个戏剧极端狂热爱好者，立志献身戏剧艺术。
